Научно-исследовательская база для осуществления научно-исследовательской деятельности включает в себя материально-технические и информационные ресурсы следующих структурных подразделений университета:
Институт истории и международных отношений
Институт филологии и журналистики
Механико-математический факультет
Факультет иностранных языков и лингводидактики
Факультет компьютерных наук и информационных технологий
Факультет нано- и биомедицинских технологий
Факультет нелинейных процессов
Факультет психолого-педагогического и специального образования
Институт археологии и культурного наследия
Научно-исследовательский институт механики и физики
Образовательно-научный институт наноструктур и биосистем
Научный медицинский центр (Лаборатория "Дистанционно управляемые системы для тераностики" Лаборатория биомедицинской фотоакустики, Лаборатория "Системы поддержки принятия врачебных решений", Лаборатория "Умного сна", Научно-методический центр психологической и педагогической поддержки семей, имеющих детей с особыми образовательными потребностями, Виварий)
Центр коллективного пользования