Область профессиональной деятельности магистров по направлению подготовки 06.04.01 Биология – исследование биологических систем различных уровней сложности, механизмов их авторегуляции и авторепродукции, использование биологических систем в хозяйственных и медицинских целях, охрана природы. Для обучения в магистратуре принимаются выпускники высших учебных заведений, имеющие степень бакалавра по биологическим и смежным научным направлениям. 

При разработке  основных образовательных программ по направлению 06.04.01 Биология большое внимание было уделено направлениям исследований научных организаций Поволжского региона: РосНИПЧИ «Микроб», Института биохимии, физиологии растений и микробиологии РАН (ИБФРМ РАН), Саратовского филиала Института проблем экологии и эволюции РАН (ИПЭЭ РАН) и др. На базе научных учреждений, а также кафедр и лабораторий биологического факультета магистранты проходят научно-исследовательские практики, выполняют курсовые и выпускные квалификационные работы. 

Выпускники, получившие степень магистра, подготовлены к работе на должностях биолога, инженера-исследователя, научного сотрудника в научно-исследовательских и научно-производственных учреждениях, к педагогической деятельности на должности преподавателя учреждений среднего профессионального образования, начального профессионального образования, высшего профессионального образования, к обучению в аспирантуре.

Обучение студентов осуществляется в рамках следующих научных направлений биологического факультета: экология растений и животных, флористика, фаунистика, почвоведение, структура и функционирование наземных и водных экосистем.